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腸道微生物測序,你準備好了嗎?

   日期:2017-04-05     瀏覽:128    
核心提示:發(fā)布日期:2017-04-05 成人腸道內生存著約100萬億微生物,加在一起有足球大小,它們與人

發(fā)布日期:2017-04-05

成人腸道內生存著約100萬億微生物,加在一起有足球大小,它們與人是共生關系。因此,人不僅是一個“人”,也是與共生微生物組成的微環(huán)境。

人與腸道微生物是有關利害關系的雙方,一方的健康狀態(tài)會影響另外一方。許多研究表明,一方面,人生病時,比如感冒發(fā)燒,或者更直接一些,有與腸道相關的疾?。ńY腸炎及炎癥性腸病等等)時,腸道微生物群的組成就會發(fā)生很大的變化?;疾∑陂g飲食的變化以及抗生素的服用,也會加劇腸道微生物群組成的改變。這同時也表明,通過腸道微生物基因組的分析,可以檢測人的某些健康狀態(tài)。

基因組測序檢測實踐意義主要體現(xiàn)在三個方面:第一,某些腸道疾病檢測往往要用到像腸鏡這種侵入式手段,而腸道微生物的測序分析則不用。第二,腸道微生物測序的敏感性更高。比如,腸道有炎癥和少量出血,就會造成Fusobacterium這種細菌的滋生。有針對性地檢測其變化,可以在出血量很少的時候就發(fā)現(xiàn)。第三,腸道微生物測序的檢測范圍更廣。對于全基因組測序而言,不僅能檢測微生物的組成變化,而且可以根據(jù)序列分析,檢測抗生素抗性基因的存在及豐度,有利于個性化針對性的醫(yī)療,既提高效率又能在一定程度上節(jié)省成本。

另一方面,腸道微生物的組成變化,特別是有害菌的滋生,也會反過來影響宿主的健康。因此,通過某些手段,比如飲食、調整腸道微生物的組成,也可以間接調整宿主的健康狀態(tài)。腸道微生物以分解人不能消化的成分生存,因此人吃什么,就在一定程度上決定了腸道微生物群的分布和豐度。青菜和雜食中含有許多不易消化的纖維,適量的食用這些既有益腸道微生物的多樣化,也可預防糖尿病和肥胖。肉類,特別是所謂的紅肉,雖然能提供豐富的蛋白質,但多食的害處也是多方面的:第一,容易造成熱量過剩。這不僅因為肉本身的熱量就很多,不能被人消化的部分含有的脂肪也相對較多,被腸道微生物分解后產生的大量能量也都由宿主吸收。第二,動物飼養(yǎng)過程中往往使用很多抗生素,已經(jīng)有研究證明后者的使用會引起動物和人的肥胖。

直接干預腸道微生物的組成,比如通過所謂的糞便植入手術,是近年來興起的新型醫(yī)療方式之一。顧名思義,就是將健康人的糞便通過手術植入到病人腸道內,以達到改善受者腸道微生物環(huán)境,進而改善受著健康的目的。這種方式雖然聽起來很惡心很離譜,但國外已有不少成功的案例。只是,在什么情況下需要實施此種療法,糞便提供者如何篩選,又如何與受者配型,目前還沒統(tǒng)一的標準。

除此之外,腸道微生物基因組測序也開始了商業(yè)化的試水了;目前國外有不少提供相關服務的公司或者機構。其流程通常是這樣的:用戶網(wǎng)上訂購并付款,公司/機構郵寄收集樣品所需用具和指南,用戶按指南收集樣品(通常是排便后從衛(wèi)生紙上用棉簽刮?。┎⒒丶慕o公司,公司進行測序、分析并將結果告知用戶。測序的方式通常有全基因組測序和16S測序兩種。后者的費用通常比前者要低很多。用戶得到的結果則通常包含以下內容:用戶腸道微生物的種類及豐度(占總體的百分比),以及與機構數(shù)據(jù)庫其它用戶的比較。

據(jù)筆者了解,目前歐德國市場的My.microbe和美國市場的American gut及uBiome等都提供腸道基因測序服務。My.microbe依托于歐洲分子生物學實驗室,也是最早提供腸道基因組測序的機構。它使用全基因組測序,因此費用也是最貴的,約800歐元(5000多人民幣)。后兩家則使用16S測序,費用在100美元以下(約合600元人民幣左右)。American gut在英國也提供測序服務,其名稱也相應改為British Gut。My.microbe和American gut都是非盈利性的。uBiome則是一家商業(yè)公司,而且是一家運作的很不錯的公司;據(jù)公司頁面介紹,uBiome分別于2014年6月和8月收到共450萬美元的資金支持。這意味著,至少在外國投資人眼中,腸道基因組測序的商業(yè)“錢”景還是很光明的。

由于西方管理機構對基因組測序在醫(yī)療領域應用態(tài)度謹慎,這些公司和大多測序公司一樣,都在網(wǎng)站或用戶說明文檔內明確表示:只反饋給用戶結果,不提供疾病診斷服務。但從結果本身,以及與其它用戶或標準健康對照組的腸道微生物群組成的比較,用戶就能得到許多與自身健康有用的信息。比如,如果與其它健康用戶相差較大,就意味著就可能有健康隱患。肉食者與素食者的腸道微生物組成都各有特點,用戶可根據(jù)自身的結果自行調整飲食結構。此外,腸道炎癥與出血等狀況都會引發(fā)某些微生物的增加(比如上面提到的Fusobacterium);如果用戶出現(xiàn)了對應的情況,那就需要進一步檢查了。

這里需要提到的一點,標準健康對照組人群腸道微生物群組成一般因國家地域而不同。因此不能拿歐美人的標準來衡量我們,也不能用北方人衡量南方人。這就意味著,建立我們自己的標準對照并研究其地域特征,是走向應用的第一步。

綜上所述,雖然在醫(yī)療診斷方面有政策因素的限制,腸道微生物測序還是有許多現(xiàn)實用途的。等到將來政策全面放開之后,腸道微生物測序成為我們生活的必備,也不是沒有可能的。

作者:陳衛(wèi)華 來源:第一財經(jīng)

來源:第一財經(jīng)

 
 
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